Die Stadt zählte Ende 1999 insgesamt 5990 medizinische Einrichtungen auf den drei Ebenen Stadt, Gemeinde (Kreis) und Wohnviertel und 68 000 Krankenbetten. 116 600 Fachleute waren im Gesundheitswesen tätig. Auf 1000 Einwohner entfielen 4,79 Ärzte und 6 Krankenbetten. Der Gesundheitszustand der Stadtbewohner verbesserte sich merklich, die wichtigsten Gesundheits- und Hygieneindizien erreichten den fortgeschrittenen Stand der Entwicklungsländer. Die durchschnittliche Lebenserwartung betrug 74 Jahre.

Der Bereich Neurochirurgie und die Behandlung von Augenerkrankungen, Nasen-, Hals- und Ohrenkrankheiten sowie Kinderkrankheiten haben den Stand der entwickelten Länder erreicht oder sich ihm angenähert. Viele Forschungsergebnisse von Weltniveau sind erzielt worden.

In der Stadt gibt es 336 Betriebe für traditionelle chinesische und westliche Pharmazie, über 400 Unternehmen für medizinische Instrumente und Apparate und ca. 1000 Apotheken. Die traditionelle chinesische Medizin und Pharmazie mit dem Unternehmen Tongrentang als Vertreter genießt im In- und Ausland ein hohes Ansehen. Beijings Mittel und Techniken für die Familienplanung stehen in China an der Spitze. Die in der Stadt hergestellten Einrichtungen zur Strahlenbehandlung haben auf dem Binnenmarkt einen Anteil von 60 %, und Beijings elektronischer Linearbeschleuniger mit stehender Schwingung vom Typ BI zur medizinischen Behandlung wurde mit dem Staatspreis 1. Klasse für wissenschaftlichen und technischen Fortschritt ausgezeichnet.